Учёные впервые извлекли ДНК древних медведей из фрагментов кала

Секвенированы ДНК из отложений в пещере на севере Мексики: ученые получили ядерные геномы двух видов североамериканских медведей.

Исследования пещеры Чикиуите (Chiquihuite) ведутся с 2012 года. Там были обнаружены каменные орудия труда возрастом от 25 000 до 30 000 лет. В нынешнем исследовании молекулярный палеоэколог Миккель Винтер Педерсен (Mikkel Winther Pedersen) и его коллеги хотели определить, какие еще виды животных бывали в этой пещере. Для этого они взяли 48 образцов с разных уровней отложений на дне пещеры и попытались извлечь ДНК. При этом они не остановились на выделении только митохондриальной ДНК, как делалось в предыдущих работах по выделению древней ДНК из почвы, а секвенировали всю ДНК в каждом образце. Для этого ученые воспользовались методами, позволяющими расшифровать миллиарды нуклеотидных оснований всего за несколько дней, и разработали компьютерное программное обеспечение для обработки и анализа всех этих данных.

«Когда животное или человек мочится или испражняется, клетки организма также выводятся из организма. И фрагменты ДНК этих клеток — это то, что мы можем обнаружить в образцах почвы. Используя чрезвычайно мощные методы секвенирования, мы впервые реконструировали геномы — генетические профили — на основе об этих фрагментов», — объясняет палеогенетик Эске Виллерслев из Копенгагенского университета.

Исследователи секвенировали геномы двух видов медведей, посещавших пещеру. Прочитанные фрагменты они сопоставили с ДНК медведей, уже имеющимися в общедоступных базах данных. По митохондриальной ДНК исследователи смогли определить, что предки медведей барибалов (Ursus americanus) жили в районе пещеры долгое время — в течение по крайней мере 3000 лет. Другой геном соответствовал ныне исчезнувшему виду — гигантскому короткомордому медведю (Arctodus simus), который вымер около 11 000 лет назад и наиболее известен по окаменелостям, найденным в Канаде.

Результаты позволили выяснить судьбу медведей Северной Америки во время последнего оледенения и сразу после него. Сравнив геномы древних барибалов с геномами их сородичей со всей Северной Америки, команда Педерсена выяснила, что по мере исчезновения льда в Северной Америке некоторые барибалы переместились на север, распространившись вплоть до Аляски. Другие спаривались с барибалами с более далекого запада, а их потомки впоследствии заселили юго-запад США.

Авторы подчеркивают, что их работа не только дает представление о судьбе американских медведей, но и служит доказательством действенности метода. Она демонстрирует, как можно анализировать древнюю ДНК из образцов окружающей среды аналогично тому, как это делается сейчас с ДНК из ископаемых останков животных.

Ещё по теме: Загадочная болезнь превращает чёрных медведей в дружелюбных собак

Про животных — в соцсетях: • Facebook • ВКонтакте • Одноклассники

Polit.ru

Назван вид рака, наиболее вероятный у женщин среднего возраста

Предупредил об опасности онколог Алексей Муравлев, прочесть стоит всем дамам (и их мужчинам)

Найден гениальный способ справиться с запором

Открыл миру глаза на работу кишечника британский хирург Каран Раджан

Ранее облысение у мужчины может быть очень тревожным признаком болезни

Облысение в большинстве случаев передается по наследству, определяется гормоном тестостероном или может быть вызвано хроническим стрессом. К нему также может привести злоупотребление курением, спиртным, или дефицит витаминов, железа и цинка, пояснила терапевт Оксана Драпкина.

Корейские ученые решительно раскритиковали большие подушки

Оказывается, спать на большой подушке небезопасно

Желтеют зубы? Вероятны две причины

Белизна зубов — непростая задача, тем более что возрастом эмаль меняет свой цвет. Однако зубы желтеют быстрее, если допускать эти две ошибки, говорится в публикации Wales Online.