Учёные впервые извлекли ДНК древних медведей из фрагментов кала

Секвенированы ДНК из отложений в пещере на севере Мексики: ученые получили ядерные геномы двух видов североамериканских медведей.

-

Исследования пещеры Чикиуите (Chiquihuite) ведутся с 2012 года. Там были обнаружены каменные орудия труда возрастом от 25 000 до 30 000 лет. В нынешнем исследовании молекулярный палеоэколог Миккель Винтер Педерсен (Mikkel Winther Pedersen) и его коллеги хотели определить, какие еще виды животных бывали в этой пещере. Для этого они взяли 48 образцов с разных уровней отложений на дне пещеры и попытались извлечь ДНК. При этом они не остановились на выделении только митохондриальной ДНК, как делалось в предыдущих работах по выделению древней ДНК из почвы, а секвенировали всю ДНК в каждом образце. Для этого ученые воспользовались методами, позволяющими расшифровать миллиарды нуклеотидных оснований всего за несколько дней, и разработали компьютерное программное обеспечение для обработки и анализа всех этих данных.

«Когда животное или человек мочится или испражняется, клетки организма также выводятся из организма. И фрагменты ДНК этих клеток — это то, что мы можем обнаружить в образцах почвы. Используя чрезвычайно мощные методы секвенирования, мы впервые реконструировали геномы — генетические профили — на основе об этих фрагментов», — объясняет палеогенетик Эске Виллерслев из Копенгагенского университета.

Исследователи секвенировали геномы двух видов медведей, посещавших пещеру. Прочитанные фрагменты они сопоставили с ДНК медведей, уже имеющимися в общедоступных базах данных. По митохондриальной ДНК исследователи смогли определить, что предки медведей барибалов (Ursus americanus) жили в районе пещеры долгое время — в течение по крайней мере 3000 лет. Другой геном соответствовал ныне исчезнувшему виду — гигантскому короткомордому медведю (Arctodus simus), который вымер около 11 000 лет назад и наиболее известен по окаменелостям, найденным в Канаде.

Результаты позволили выяснить судьбу медведей Северной Америки во время последнего оледенения и сразу после него. Сравнив геномы древних барибалов с геномами их сородичей со всей Северной Америки, команда Педерсена выяснила, что по мере исчезновения льда в Северной Америке некоторые барибалы переместились на север, распространившись вплоть до Аляски. Другие спаривались с барибалами с более далекого запада, а их потомки впоследствии заселили юго-запад США.

Авторы подчеркивают, что их работа не только дает представление о судьбе американских медведей, но и служит доказательством действенности метода. Она демонстрирует, как можно анализировать древнюю ДНК из образцов окружающей среды аналогично тому, как это делается сейчас с ДНК из ископаемых останков животных.

Ещё по теме: Загадочная болезнь превращает чёрных медведей в дружелюбных собак

Про животных — в соцсетях: • Facebook • ВКонтакте • Одноклассники

Polit.ru

Диетолог сообщает о связи между чипсами и депрессняком

Эксперт считает, что чипсы и другой фаст-фуд связаны с депрессией, так как люди, имеющие к ней склонность, пытаются утешить себя таким образом.

«Яблочникам» обещано управление айфоном силой мысли

Компания Apple планирует внедрить технологию управления iPhone посредством мысленных команд.

О вкусах не спорят, но что полезней: клубника или черешня?

Специалисты Роспотребнадзора рассказали о пользе клубники и черешни. Одна из популярных ягод оказалась идеальной для диет

Тысячам пылающих страстью жаб обеспечен безопасный переход через дорогу

Амфибии массово направлялись к местам нереста в заказнике «Сестрорецкое болото» в Ленинградской области

Открыто перспективное средство от проблем с пищеварением

Группа международных ученых обнаружила, что экстракт из Arbutus unedo, широко известного как земляничное дерево, может быть эффективным средством в борьбе с язвенным колитом.